L’amplification génique (PCR) a une excellente sensibilité et spécificité pour le diagnostic de l’infection.
Elle permet en outre la détermination des principales mutations impliquées dans la résistance aux macrolides (clarithromycine) et, pour le test HelicoDR®, également aux fluoroquinolones (levofloxacine).
Elle est donc une alternative à la culture avec antibiogramme d’autant qu’elle nécessite des conditions de transport moins contraignantes que la culture. Plusieurs techniques de PCR sont commercialisées mais aucune n’est encore remboursée par l’assurance maladie.